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Es handelt sich um die Java Portierung von JOELib. Benötigt zur Installation den Ant-Makefile-Mechanismus. Gut dokumentierte Modularisierbarkeit.

Zeichnet sich außerdem durch zusätzliche Berechnungsmöglichkeiten für Deskriptoren (Atom, Bindungs- oder Moleküleigenschften) aus, und erlaubt es Prozessketten aufzubauen. Bei Prozessketten kann es sich etwa um externe Programme handeln, die über unterschiedliche Schnittstellen (JNI, IO-Streams oder Datein) mit anderen Programmen kommunizieren. JOLib unterstützt SMARTS - Substruktursuche und die Möglichkeit zur Berechnung von Fingerprints zur Ähnlichkeitssuche in Moleküldatenbanken. Zur Visualisierung sind bisher ein Molekülbetrachter in Java3D und ein Tool zur Spektrenbetrachtung (JCAMP-DX, www.jcamp.org) vorhanden, welche allerdings noch nicht unter der GPL-Lizenz frei verfügbar sind.

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